Tema 20: Degradación de los aminoácidos

Su  función más aceptada es la de inducir cambios conformacionales tanto en las proteínas a degradar como en el  proteasoma para facilitar el acceso de  las proteínas al interior del ‘barril’ de subunidades b. Adicionalmente, las cofias contienen una isopeptidasa que libera la ubiquitina. Las cofias actúan de filtro del barrilete. El proteosoma de arquobacterias presenta que todas las subunidades α y β son idénticas, mientras que en el de eucariota hay 7 isoformas a y b distintas (ganancia: mayor especificidad de sustrato). La eliminación del nitrógeno es la primera etapa en la degradación de aminoácidos.

El aminoácido pasa el grupo amino al glutamato que realiza la aminotransferasa y la glutamato deshidrogenasa. La aminotransferasa transfiere el amino al cetoacido y la pasa al glutamato. La glutamato deshidrogenasa le quita el amino y separa el amonio. La transaminasa también genera la base de Schiff. Se genera una aldamina interna. En el centro catalítico esta el aspartato que se transfiere a una aldimina externa que evoluciona por la desaminizacion. La aspartato aminotransferasa que lleva a su interior del centro catalítico, una arginina que chupa los electrones. La aldimina pasa a cetoamina. La cetoamina se hidrata pasando a cetoacidos. Actúa como sumidero de electrones. La serina pasa a piruvato mediante la acrilamida. El músculo genera más piruvato del que puede catabolizar y lo pasa a lactato. Al piruvato le ponen un amonio y se genera la alanina. La alanina es utilizada por la gluconeogenesis. La excreción del nitrógeno es mediante el ciclo de la urea. La mayoría de los vertebrados son urotelicos. El músculo transporta el amonio mediante alanina y los demás la exporta la glutamina que llega al hígado. El hígado es quien produce la urea. El amonio se condensa con dióxido de carbono generando el carbonil fosfato que se produce ormitina que pasa a citrulina que va al citosol. La citrulina más aspartato se condensan en earginosuccionato que se escinde para formar arginina y fumarato que se libera. La arginina pasa mediante una hidratación a urea y la regeneración de la ormitina. El ciclo de la urea se conecta con el ciclo de los ácidos tricarboxilicos. En mamíferos hay dos izo enzimas distintas: la mitocondrial que es activada por el N-acetilglutamato by la citosolica se encarga de la biosíntesis que se encarga de la biosíntesis de pirimidinas que utiliza a la glutamina en la donación de nitrógeno. El bicarbonato pasó a carboxifosfato mediante el gasto de ATP siendo una activación. Posteriormente reacciona con el amonio pasando a acido carbónico. El acido carbónico pasa a carbonil fosfato. Esta se condensa con aspartato mediante la argiminosuccionato sintetasa que produce una adenilacion que genera el organismo succinato. De aquí pasamos a arginina y fumarato. La argimina pasa a ormitina y la urea.