viernes, 31 de enero de 2020

TEMA 22: METABOLISMO DE NUCLEÓTIDOS DE PIRIMIDINA Y PURINA


IDP e ITP no son muy abundantes, pues no se generan a partir de nucleósidos monofosfato (como ocurre en pirimidinas).
IMP genera AMP y GMP. Para producir AMP hace falta un cofactor (además del aspartato): el GTP. Para producir GMP hace falta ATP. Esto se debe a que las células necesitan un nivel balanceado de ATP y GTP.
El grupo carbonilo del IMP se activa por GTP (proteína G), se forma adenil-succinato y se libera fumarato, formando adenilato AMP.
Para dar GMP, el IMP se oxida a xantinamonofosfato, que es el precursor de guanina (por una reacción muy parecida a la carbamil-P sintetasa y CTP sintetasa: es la GMP sintetasa).
Ahora AMP y GMP pasan a ADP y GDP y éstos a ATP y GTP.
Biosíntesis de los desoxirribonucleótidos
Se producen a partir de los ribonucleótidos. Intervien la ribonucleótido reductasa. Ésta presenta diferentes cofactores y subunidades según el organismo.
En E.coli hay dos subunidades: R1 (catalítica: 1 Glu y 3 Cys) y R2 (reguladora: agrupación de His y Glu con dos átomos de Fe cerca de una Tyr). En otros organismo no está R2, sino cianocobalamina.
El mecanismo catalítico es radicálico. Se le quita un electrón y un protón a la cys del centro catalítico, formando un radical que es el que ataca al ribonucleótido.
La tyr de la subunidad R2 es la que quita el electrón a la cys, formando un radical de tyr. El radical que queda en la cys (S-) ataca a la ribosa,quitándole un electrón. Se forma un radical ribosilo.
Esto se equilibra perdiendo agua y ya ha aparecido la desoxirribosa. El radical migra a la posición anterior y resetea.
Se libera la desorribosa, pues se ha perdido un anclaje con la enzima. En la última etapa se recupera el electrón a la cys. La enzima se queda casi igual que al principio. Hay una diferencia: los dos tioles forman un puente disulfuro. Esto hace que la enzima no pueda empezar otro ciclo. El puente disulfuro debe reducirse a dos tioles separados. Esto lo hace la tiorredoxina-tiorredoxina reductasa. Este sistema gasta NADPH.
Por esto, la biosíntesis de desoxirribonucleótidos requiere NADPH.
En algunos organismos la fuente de radicales es la adenosilcobalamina, no una tirosina.
Dado que las enzimas primordiales se inactivaban por el oxígeno, la existencia de una arquitectura proteica común para las ribonucleótidos reductasas sugiere que las proteínas se incorporan al mundo de RNA antes de que el DNA hubiese evolucionado como forma estable de almacenamiento de la información genética.
Biosíntesis del timidilato (dTMP)
Se produce a partir de dUMP. La diferencia de T con respecto a U es la presencia de un metilo en posición 5’ (el donador del metilo es el metilentetrahidrofolato). Se genera el timidilato (dTMP).
El tetrahidrofolato está actuando transfiriendo electrones. Se genera dihidrofolato, que pasa a tetrahidrofolato (depende de NADPH) y éste se carga a metilentetrahidrofolato (el donador es serina).
Este ciclo es específico para construir el DNA. Los inhibidores de estas enzimas se utilizan en la quimioterapia. Hay dos puntos de ataque: timidilato sintasa (se utiliza fluorouracilo) y dihidrofolato reductasa (aminopteria y metrotexato: Ki = 1nM, por lo que es muy selectivo). El bloqueo de la timidilato sintasa por fluorodesoxiuridilato es un ejempli de inhibición suicida (modificación covalente o estable del centro catalítico).
Regulación de la biosíntesis de novo de los nucleótidos y su reciclaje
La biosíntesis de novo de las pirimidinas tiene un control alostérico por inhibición. La ATC depende de la concentración de aspartato. Las subunidades reguladoras son dímero y las catalíticas son trímeros.

lunes, 20 de enero de 2020

TEMA 22: METABOLISMO DE NUCLEÓTIDOS DE PIRIMIDINA Y PURINA


Biosíntesis de novo de los nucleótidos de pirimidina
La procedencia de los átomos del nucleótido de pirimidina es en parte del aspartato. Los otros dos átomos del anillo de 6 miembros provienen del carbamil-P.
Una vez sintetizado el anillo de pirimidina, se empieza a sintetizar el nucleótido. Es decir, el anillo se une a una fosforribosa activada (mediante la formación del pirofosfato de ribosa).
Primero se genera UTP, que es la precursora metobólica de CTP y de dTMP. CTP es el precursor de dCTP.
La carbamil-P sintetasa realiza la activación de un grupo carbonilo por fosforilación para formar carboxi-P. Éste sufre un ataque nucleófilo, formando ácido carbámico. Éste por fosforilación de carbamil-P.
La carbamil-P sintetasa está muy estudiada. Tiene tres dominios diferenciados (la isoforma citosólica): El dominio de unión del donador de nitrógeno (glutamina), el dominio de fosforilación del bicarbonato y el dominio de fosforilación del ácido carbámico.
El amonio liberado difunde hasta el dominio de fosforilación del bicarbonato; el ácido carbámico migra al dominio de fosforilación del ácido carbámico, para dar carbamil-P. Éste a pH 7 es muy inestable y se descompone, por lo que debe estar protegido del medio externo.
La siguiente etapa es muy importante en la regulación. Está catalizada por la aspartato transcarbamilasa (ATC). Ésta tiene 6 subunidades catalíticas y 6 subunidades reguladoras.
El carbamil-P se condensa con aspartato, formando carbamil-aspartato, quien se cicla formando un enlace amida y da lugar al dehidrooro, que se oxida y forma oorotato (está catalizado por la dihidroorotato deshidrogenasa).
Cuando el oorotato se condensa con PRPP se forma orotidilato, que mediante una descarboxilación se transforma en UMP (primer nucleótido sintetizado). Está catalizada por la orodilato descarboxilasa. UMP se transforma en UTP, mediante una acción secuencial de nucleósidos-monofosfato quinasas y nucleósidos-difosfato quinasas (UMPàUDPàUTP).
UTP es el precursor de CTP (mediante una sustitución de un grupo ceto por un grupo amino) por la CTP sintetasa, que es muy parecida a la carbamil-P sintetasa. Es una reacción muy idéntica a la de la formación del carbamil-P.
Biosíntesis de novo de los nucleótidos de purina
La estructura del anillo de purina proviene de la acción combinada de varios compuestos. Aspartato es el donador de un nitrógeno. CO2 dona un carbono. Glutamina dona dos N y el tetrahidrofolato dona 2 C y glicina dona el último C.
Los nucleótidos de purina se construyen sobre ribosa-P directamente (se sintetiza directamente el nucleótido, no el anillo como ocurre en pirimidinas). El primer nucleótido generado es IMP. Es el precursor de ATP y GTP en el RNA y de dATP y dGTP en el DNA.
Tipos de reacciones repetitivas:
-Activación por fosforilación de un grupo carbonilo.
-Sustitución del grupo fosfato por amoniaco o por un grupo que actúa como nucleófilo.
A la ribosa 1-PPi se le incorpora un amino y luego una glicina, formando glicinamida ribonucleótido. Éste coge THF y da formilglicinamida ribonucleótido y éste coge glutamina y da formilglicinamidina ribonucleótido. Éste da 5-aminoimidazol ribonucleótido (ciclación por activación con ATP). Éste se activa y se realiza una migración tautomérica. Ahora hay otra activación y otro ataque nucleofílico, formando el succinil-derivado del nucleótido (es la misma reacción repetida “n” veces).
A partir de este derivado succinil, para llegar a IMP, hay varias etapas. Aspartato dona un nitrógeno y se libera fumarato. Ahora se incorpora otro THF. Hay una deshidratación y se produce inosinato (IMP). La base púrica contenida en el IMP es la hipoxantina.

viernes, 10 de enero de 2020

TEMA 21: BIOSÍNTESIS DE LOS AMINOÁCIDOS


La inhibición es de tipo alostérico. La 3-P-glicerato deshidrogenasa es un tetrámero: posee dos centros de unión para serina y dos para NADPH. La inhibición más potente es la de serina.
Las células necesitan coordinar los niveles de unos aa con otros. Para ello utilizan retroinhibición por retroactivación. Ej: ruta de biosíntesis de aa con cadenas laterales alifáticas. Se intenta mantener unos niveles balanceados de leu, val e ile. Todas provienen de hidroxietilo-TPP. Las dos rutas divergen a partir del hidroxietilo-TPP. Una vía coge α-cetoglutarato (que es la que se modula). Se utiliza ile para inhibir su producción (cuando está muy alta). Val atenúa la inhibición por ile. Por tanto, el flujo metabólico se regula de una forma balanceada cruzada.
Lys, met y thr proceden de aspartato. Comienza con la formación de aspartil-P (mediante aspartato quinasa). Esta enzima es el punto de control. Se sintetizan isoenzimas de la aspartato quinasa. Hay 3 isoformas: una que no se regula por aa. finales, otra que es sensible a thr y otra sensible a lys.
La regulación más importante está a nivel de la glutamina sintetasa. Es un sistema alostérico muy importante. Es un control alostérico por modificación covalente post-traduccional y retroinhibición acumulativa (2 mecanismos).
Es una enzima con dos anillos con 6 miembros cada uno. La modificación postraduccional es una adenilación: la enzima se modifica por la incorporación de AMP. El donador de AMP es ATP y se libera PPi (reacción irreversible hacia la derecha). El sistema que la activa es la adenilil-transferasa, que requiere un cofactor proteico: PA (proteína adenilante). También hay una proteína desadenilante (PD). Son la misma proteína con dos actividades diferentes.
La adenilación tiene lugar en un residuo de tyr de esta enzima. La adenilación disminuye la actividad de la glutamina sintetasa. Pero todavía queda actividad. Los niveles de productos del metabolismo del N de la célula terminan de cerrar la actividad de la glutamina sintetasa.
Por tanto, hay retroinhibición acumulativa. Los compuestos que informan de la cantidad de N son trp e his, pero también carbamil-P, glucosamina-6-P y CTP y AMP.
La proteína reguladora P es un trímero (trisquelión) que puede actuar en un hexámero. Se encuentra en dos estados: PA y PD (dos estados conformacionales diferentes de la misma proteína). El cambio conformacional lo produce una uridilación. La transformación de PA en PD requiere UTP, que se esciende pirofosfatolíticamente. B estimula la desadenilación de la glutamina sintetasa.
(Por tanto, la proteína P es un integrador del flujo metabólico hacia las bases púricas y pirimidínicas).
Glutamina inhibe la transformación de PA en PD y activa la transformación de PD en PA. Por tanto la glutamina inactiva a la glutamina sintetasa.
α-cetoglutarato y ATP activan la transformación de PA en PD e inhiben la transformación de PD en PA. Por tanto, ATP y α-cetoglutarato activan la glutamina sintetasa.
Los aa son los precursores de muchas biomoléculas. Biosíntesis de porfirinas y porfirias
Glicina y serina son los precursores de los derivados de los aa.
La selenocisteína es el aa nº 21. Es un aa que está presente en muchos seres vivos (pero no en todos). Se encarga de resetear peróxidos. Se condensa con glutatión y forma selenolato, que reduce peróxidos.
Las porfirinas se sintetizan en animales y bacterias a partir de glicina y succinil-CoA. En plantas es a partir de glutamato.
Durante esta ruta se produce la cobalamina (deriva de una porfirina 1ª).
La protoporfirina IX genera el grupo hemo en eucariotas y procariotas y las ficobilinas de algas.
Si a la protoporfirina IX se le une Mg, se forma la clorofila a, que forma las otras clorofilas.
La biosíntesis del grupo hemo en animales y bacterial comienza con succinil-CoA, que se condensa con glicina y forma el δ-amino-levulinato. Se utiliza la δamino-levulinato sintasa, que es una enzima mitocondrial que contiene PLP.
Dos δ-amino-levulinatos se condensan y se produce porfopirinógeno. Un tetrapirrol necesita, para formarse, 8 δ-amino-levulinato.
Se genera el 1-porfirinógeno 3 por la enzima cosintasa, que en última instancia es el precursor de protoporfirina IX. Los déficits de cosintasa producen personas pálidas.
Las personas con uroporfirinógeno I poseen dientes rojos, que en la oscuridad se ven fluorescentes, la orina es roja, la piel es sensible a la luz y tienen disfunciones neurológicas severas (son “vampiros”).
Las personas con porfirias padecen locura transitoria.
-La degradación del grupo hemo produce biliverdina y bilirrubina (ictericia natal, si hay mucha acumulación). La degradación de los tetrapirroles requiere oxígenos (intervienen oxigenasas).

martes, 31 de diciembre de 2019

TEMA 21: BIOSÍNTESIS DE LOS AMINOÁCIDOS


Para formar arg, el γ-semialdehído-glutámico acepta glutamato y forma ornitina, y ésta pasa a arginina.
-El 3-P-glicerato da serina, glicina y cisteína. El 3-P-glicerato pasa a 3-P-hidroxipiruvato, quien acepta glutamato y libera α-cetoglutarato produciendo 3-P-serina (reacción de transaminación). Éste se hidroliza y forma serina. Serina es el precursor de glicina. En el catabolismo de glicina se genera serina. A partir de serina y homocisteína se forma cistationina, quien produce cisteína (en animales, cys se forma a partir de met; bacterias pasan cys a acetil-serina, quien acepta H2S y forma serina).
Tetrahidrofolato y S-adenosin-metionina: transferencia de fragmentos de un carbono
Ambos transfieren fragmentos de 1C. Pero tienen distintas actividades. El tetrahidrofolato es el agente más versátil en la transferencia de fragmentos de 1C. Los transfiere en casi todos los estados de oxidación. La forma más reducida es -CH3 (metilos), también –CH2- (metileno), y la más oxidada es –CHO, -CHNH, -CH-. Lo único que no transfiere es CO2. Para esto se utiliza biotina. Por tanto, se forma metiltetrahidrofolato, meteniltetrahidrofolato y formiltetrahidrofolato.
La S-adenosin-metionina es el agente con mayor potencial de transferencia de metilos. Se forma a partir de metionina y requiere la escisión de ATP en Pi y PPi. S-adenosin-metionina sólo transfiere metilos.
-Ciclo de los metilos activados (ver diapositiva). En él participan S-adenosin-metionina y tetrahidrofolato. La metilación tiene mucha más importancia en los factores epigenéticos, como la metilación del DNA.
Además, la S-adenosin-metionina tiene otras funciones en plantas. Aquí es el precursor del etileno (hormona vegetal).
En animales, la S-adenosin-metionina dona esqueleto hidrocarbonado para la síntesis de poliaminas: putresfina (olor de cadáveres), espermidina y espermina. Estos dos últimos son agentes en el control de la proliferación celular (en el semen).
Biosíntesis de aa aromáticos: vía del siquimato/corismato
Esta ruta sintetiza aa aromáticos y también coenzima Q. Además, en plantas, se genera el paraaminobenzoico (precursor del tetrahidrofolato).
Eritrosa-P y P-enolpiruvato son los precursores de estos aa. Tras la condensación, hay una oxidación, que sigue con reacciones que producen siquimato (ácido cíclico carboxílico con 3 hidroxilos).
El siquimato se activa y se condensa con P-enolpiruvato, formando corismato (uno de los intermediarios de esta vía: el gliosfato se utiliza como herbicida).
Corismato es el precursor de prefenato (por transferencia de grupos). El prefenato es el precursor de fenil-piruvato (ácido conjugado de phe) y parahidroxifenilpiruvato (ácido conjugado de tyr). Ambas son reacciones de transaminación.
La síntesis de trp cursa a través de antranilato, que libera amoníaco de la glutamina. Se forma un intermediario 5-P-ribosil-1-pirofosfato (interviene en la síntesis de purinas).
El indol-3-glicerol-P es el precursor de trp (por la triptófano sintasa). Primero se forma un intermediario indol, que pasa a trp (utilizando serina).
La trp sintasa tiene dos subunidades: alfa (tiene un centro catalítico que genera indol) y beta (tiene un centro catalítico que genera trp). Ambas están separadas unos 25 A. El indol que se forma en la subunidad alfa difunde por el interior de la proteína hasta llegar a la subunidad beta, donde se condensa con serina (interviene PLP). Se genera trp.
Regulación de la biosíntesis de aa
Hay varios tipos de control. El más tradicional es retroinhibición por producto final. Un ejemplo: la síntesis de serina tiene lugar a partir de 3-P-glicerato. La primera etapa depende de NADPH. La inhibición para ser efectiva tiene lugar en esta primera etapa. Si son rutas ramificadas, la inhibición tiene lugar en el primer paso después de la ramificación.

viernes, 20 de diciembre de 2019

TEMA 21: BIOSÍNTESIS DE LOS AMINOÁCIDOS


Capacidad de síntesis de aa. proteicos limitado en humanos. Aa. esenciales
De los 20 aa. proteicos hay muchos que son esenciales (no podemos sintetizarlos). Arginina no es esencial, pero su capacidad de síntesis es limitada (hay que ingerirla en la dieta).
Las rutas biosintéticas no esenciales son cortas. Las rutas más largas son de aa. esenciales que no podemos sintetizar.
El ion amonio se incorpora a los aa principalmente a través de glutamato y glutamina
Además de a través de glutamato y glutamina, también se realiza a través de asparragina y carbamilfosfato (vías minoritarias). Aunque mayoritariamente se incorpora a través de glutamato y glutamina.
La glutamato deshidrogenasa se encarga de fijar el amonio (in vivo es reversible y depende de las necesidades funcionales de la célula). La esteroquímica del centro activo de esta enzima determina que el hidruro se transfiera desde el NAD(P)H para formar sólo el isómero L-glutamato.
La glutamina sintetasa es una etapa clave en el control de la síntesis de aa. Glutamato es el precursor de glutamina. La glutamina sintetasa tiene que activar el carboxilo (mediante fosforilación), para que reaccione con el amonio, formando glutamina.
La Km de la glutamato deshidrogenasa hacia amonio es alta. En procariotas hay una estrategia para conseguir amonio en ausencia de éste. La glutamato sintasa condensa α-cetoglutarato y glutamina. Luego, mediante otra reacción, se consigue amoníaco.
Hay otra vía minoritaria de incorporación de amoníaco. Se parte de aspartato y se produce asparragina.
Familias biosintéticas de los aa: precursores metabólicos de los aa
Los precursores de aa son precursores de las rutas metabólicas ya vistas. Oxaloacetato genera aspartato (transaminación). Éste genera asparragina, metionina, lisina y treonia. Éste último genera isoleucina.
P-enolpiruvato se condensa con eritrosa- 4-P para dar tirosina, triptófano y fenilalanina, que produce tirosina.
Piruvato es el precursor de alanina, valina y leucina.
Ribosa 5-P es el precursor de histidina (ruta muy importante en control génico: operón histidina).
α-cetoglutarato produce glutamato (por transaminación). Éste produce glutamina,  prolina y arginina.
El 3-P-glicerato produce serina; éste da cisteína y glicina.
Por transaminación del cetoácido precursor; por aminotransferasas:
Piruvato à Alanina;  OAA à Aspartato;  α-cetoglutarato à Glutámico
A partir de una aldimina interna, se produce piridoxamina fosfato, quien pasa a cetimina. Ésta da a una aldimina externa, quien pasa a aldimina interna, liberando el aa. (reacción de transaminación). Son reacciones esteroespecíficas: sólo se forman L-aa.
-Biosíntesis de Asparragina: el aspartato se activa a acil-adenilato intermediario, provocando la escisión de ATP. Ahora entra el NH3 y forma asparragina (enlace amida).
La formación de un enlace amida cuesta mucha energía (requiera la activación del carboxilato). En mamíferos, el donador de amoníaco es glutamina. En bacterias, entra directamente.
-El glutamato es el precursor de glutamina, prolina y arginina. El 1º es igual que antes, pues requiere la incorporación de amoníaco. Primero el glutamato debe activarse a γ-semialdehído-glutámico, mediante  una fosforilación. Éste es el precursor de pro y arg.
Para formar pro, el γ-semialdehído-glutámico se cicla y forma prolina (mediante la formación de una base de Schiff interna: aldehído y amino de la misma molécula). La hidroxiprolina se genera por hidroxilación enzimática de prolina (síntesis de colágeno).

martes, 10 de diciembre de 2019

Tema 20: Degradación de los aminoácidos


Se gasta tres ATP por cada molécula de urea. Los defectos hereditarios en el ciclo de la urea pueden ser: hiperamonemia (exceso de amonio en la sangre) hay dos puntos en los que se produce fallos. Uno de ellos es la deficiencia de arginosuccionato que se soluciona incrementando las concentraciones de arginina. La otra es la deficiencia de carbonilfosfato sintetasa o de ormitina trasncarboxilasa que se soluciona mediante un aumento de glicerina y glutamina. Al añadir benzoato o formilacetato. La degradación del esqueleto podemos dividirlos en dos tipos: cetogenicos y glucogenicos. Los glucogenicos son los que parten de la gluconeogenesis. Los cetogenicos producen compuestos cetonicos. Hay dos aminoácidos potencialmente cetonicos: leucina y lisina que no producen nada de glucosa. Los aminoácidos pueden generar otros aminoácidos. La alanina se produce desde triptofano. La glicina genera serina. La alanina, y serina general el acil CoA. La prolina pasa a glutamato. La arginina pasa a glutamato. El succionato se genera mediante la vitamina 12. La leucina que es cetogenico, genera potenciales redox como por ejemplo FADH. Se genera el 3hidroxi 3 metilglutaril CoA que es un precursor de colesterol. Este provoca enfermedades graves como acidosis. La degradación de la tiamina puede tener dos vías diferentes. En una de las vías aparece el NHF. Este proceso es reversible. Cuando no hay acido fólico se produce anemia. El acido fólico es una vitamina que se reduce produciendo NADPH. En la degradación de aminoácidos se provoca intermediarios necesarios. La arginina cursa hasta glutamato. La arginina es el precursor del oxido nítrico. La arginina genera intermediarios para los músculos, sistema nervioso y cerebro. En la degradación de aminoácidos azufrados (cisteina y metionina) están conectados. La metionina produce aldometionina que ayuda a la degradación de glutamato mediante la eliminación del agente xenobiotico. La cisteina se catabólica a piruvato pudiéndose liberar el sulfato. El catabólica muy poco. En bacterias se producen sulfuros de hidrogeno, que en mamíferos se produce muy poco. La cisteina produce las sales biliares. La ruta de degradación de metionina se denomina ruta de trans sulfuracion. La metionina pasa de 5 adenosil metionina a 5 acetil homocisteina que llega a homocisteina y adenosina. De la homocisteina puede generar la metionina mediante el acido fólico. De la homocisteina pasamos a la cisteina. La cisteina libera el sulfato que pasa a la orina y se transforma en piruvato. La metionina se activa mediante la adrenalina. En la degradación de los aminoácidos aromáticos podemos destacar a la histidina. Se produce una desaminacion oxidativa que es única en la degradación de aminoácidos, sin vitamina B5 o pirodoxal fosfato. Al final obtenemos el glutamato. El triptofano, fenilalanina y tirosona terminan en la misma vía. Necesitan reactivos diseñados por ellos. La degradación de fenilalanina da la tirosina mediante la fenilalanina hidrolasa que es una etapa de control. El cofactor que se implica es la tetrahidrobiotina que se oxida para la formación de una molécula de agua. Se resetea mediante el NADPH. La tirosina es el precursor del transmisor del placer, la dopamina que tiene un hidroxilo más y una carboxilación menos que la tiroxina. La adrenalina y noradrenalina deriva de la dopamina. A partir de la noradrenalina se genera la adrenalina. Mediante la hidroxilacion de la dopamina pasamos a noradrenalina. La dioxigenacion incorpora dos átomo de oxigeno, mientras que la monoxidasa solo incorpora una átomo de oxigeno. En la etapa cinco necesitan la incorporación de un glutation. El precursor es el NAD y NADP es el triptofano que concretamente es el PRPP. El triptofano se degrada para la formación de un neurotransmisor, que es una sustancia en la glándula pineal. La serotonina se oxida, en el que la MAO elimina el amonio y al final de la vía podemos obtener el acetil CoA. La alcaptonuria produce orina muy oscura en el que la degradación de fenilalanina y triptofano se bloquea. La fenilcetonuria  produce un gran retraso por deficiencia de tetrahidroxibiotina.

sábado, 30 de noviembre de 2019

Tema 20: Degradación de los aminoácidos

Su  función más aceptada es la de inducir cambios conformacionales tanto en las proteínas a degradar como en el  proteasoma para facilitar el acceso de  las proteínas al interior del ‘barril’ de subunidades b. Adicionalmente, las cofias contienen una isopeptidasa que libera la ubiquitina. Las cofias actúan de filtro del barrilete. El proteosoma de arquobacterias presenta que todas las subunidades α y β son idénticas, mientras que en el de eucariota hay 7 isoformas a y b distintas (ganancia: mayor especificidad de sustrato). La eliminación del nitrógeno es la primera etapa en la degradación de aminoácidos.


El aminoácido pasa el grupo amino al glutamato que realiza la aminotransferasa y la glutamato deshidrogenasa. La aminotransferasa transfiere el amino al cetoacido y la pasa al glutamato. La glutamato deshidrogenasa le quita el amino y separa el amonio. La transaminasa también genera la base de Schiff. Se genera una aldamina interna. En el centro catalítico esta el aspartato que se transfiere a una aldimina externa que evoluciona por la desaminizacion. La aspartato aminotransferasa que lleva a su interior del centro catalítico, una arginina que chupa los electrones. La aldimina pasa a cetoamina. La cetoamina se hidrata pasando a cetoacidos. Actúa como sumidero de electrones. La serina pasa a piruvato mediante la acrilamida. El músculo genera más piruvato del que puede catabolizar y lo pasa a lactato. Al piruvato le ponen un amonio y se genera la alanina. La alanina es utilizada por la gluconeogenesis. La excreción del nitrógeno es mediante el ciclo de la urea. La mayoría de los vertebrados son urotelicos. El músculo transporta el amonio mediante alanina y los demás la exporta la glutamina que llega al hígado. El hígado es quien produce la urea. El amonio se condensa con dióxido de carbono generando el carbonil fosfato que se produce ormitina que pasa a citrulina que va al citosol. La citrulina más aspartato se condensan en earginosuccionato que se escinde para formar arginina y fumarato que se libera. La arginina pasa mediante una hidratación a urea y la regeneración de la ormitina. El ciclo de la urea se conecta con el ciclo de los ácidos tricarboxilicos. En mamíferos hay dos izo enzimas distintas: la mitocondrial que es activada por el N-acetilglutamato by la citosolica se encarga de la biosíntesis que se encarga de la biosíntesis de pirimidinas que utiliza a la glutamina en la donación de nitrógeno. El bicarbonato pasó a carboxifosfato mediante el gasto de ATP siendo una activación. Posteriormente reacciona con el amonio pasando a acido carbónico. El acido carbónico pasa a carbonil fosfato. Esta se condensa con aspartato mediante la argiminosuccionato sintetasa que produce una adenilacion que genera el organismo succinato. De aquí pasamos a arginina y fumarato. La argimina pasa a ormitina y la urea.