sábado, 29 de febrero de 2020

TEMA 23: VÍAS DE TRANSDUCCIÓN DE SEÑALES DE COMUNICACIÓN INTERCELULAR


El óxido nítrico se genera a partir de arginina. Es una reacción catalizada por la NOS (óxido nítrico sintasa). Es muy importante en el cerebro.
Arginina genera citrulina y NO por la enzima NOS. Se consume oxígeno. Hay tres isoformas de NOS:
-iNOS: implicada en respuestas inflamatorias. Es inducible (se regula por niveles de expresión). Es mínima en neuronas y músculo.
-nNOS: es la isoforma neuronal. Se activa por Ca2+ intracelular.
-µNOS: es la isoforma muscular. Se activa por Ca2+ intracelular.
NO es un agente intra e intercelular. Difunde muy rápidamente por las membranas biológicas, pero al ser muy inestable, desaparece muy rápidamente. Interviene en procesos de vasodilatación a nivel tisular, inflamación tisular y neuromodulación en aprendizaje y memoria.
Muchas de estas respuestas requieren la activación de la guanilato ciclasa y la producción de cGMP.
Potenciación e integración de la respuesta celular: activación de proteínas quinasas
Las proteínas quinasas actúan potenciando y coordinando respuestas metabólicas. Además, están implicadas en la inducción de respuestas celulares que implican cambios morfológicos (alteraciones del citoesqueleto). También intervienen en la expresión de genes específicos precisos para una respuesta celular focalizada o especializada, vía fosforilación de factores de transcripción. Ej: CREB, que interviene en aprendizaje y memoria.
Todas las quinasas utilizan ATP e introducen un P en su proteína diana. Por tanto, tienen un dominio de unión de ATP. Son poco específicas, pues tienen varios sustratos diferentes. Hay tres tipos de proteínas según fosforilen sobre serinas, treoninas o tirosinas.


Las principales familias de quinasas activadas por segundos mensajeros son:
-PkA: se estimulan por cAMP.
-PkC: activadas por DAG y Ca2+.
-PkCaM: activadas por Ca2+ y calmodulina.
-PkG: activadas por cGMP y Ca2+.
-PkB: activadas por PIP2 y por la vía de las proteínas G monoméricas (crecimiento celular).
-MAPK (o ERK): se activan por proteínas G monoméricas. Intervienen en el crecimiento y diferenciación (morfogénesis de órganos y tejidos).
En general, la activación de estas proteínas quinasa implica cambios conformacionales en la subunidad catalítica, que producen la eliminación de la inhibición del centro catalítico por otros elementos estructurales de la misma. El elemento estructural inhibidor es o bien una subunidad reguladora o bien un dominio pseudosustrato de la subunidad catalítica, que actúan como tapón del centro catalítico.
La proteína quinasa C tiene un dominio de pseudosustrato, un dominio C2, el dominio proteína quinasa y un dominio C1 (rico en zinc).
La proteína quinasa C inactiva no está unida a membranas y el dominio pseudosustrato tapa al centro catalítico. Éste se libera gracias a DAG. Ahora se transloca a la membrana.
La calmodulina es el transductor más ubicuo de la señal intracelular de calcio. Es muy polivalente. Están en todas las células eucariotas.
La PkCaM sólo se activa por calmodulina unida a Ca2+, no por cada elemento por separado.
En las señales de crecimiento interviene la familia de quinasas JAK (quinasas Jano activadas). Si no se activan, no se produce crecimiento; si se sobreactivan, se produce cáncer.
JAK tiene tres dominios: un dominio de unión al receptor, un dominio SH2 y un dominio proteína quinasa. Las proteínas STAT son las que activan la transcripción acoplada a la transducción de señales. Se activan por fosforilación en tirosinas (JAK2). Las STAT fosforiladas se sueltan del citoesqueleto y se dirigen al núcleo, donde actúan sobre genes específicos, pues tienen dominios de unión al DNA. Por tanto, diferentes células expresan diferentes STAT.
Finalización de la respuesta celular: desensibilización, eliminación de segundos mensajeros y proteínas fosfatasas.
La eliminación de la sensibilización se hace por quinasas de receptores. Un ejemplo es la arrestina (controla el paso que realizan los ojos de captar mucha luz a captar poca; acostumbrarnos a los malos olores). Estas quinasas actúan sobre receptores activados.
La actividad GTPasa de las proteínas es un reloj que controla la duración de la transducción de la señal del receptor activado. Por tanto, las proteínas G tienen un tiempo limitado de acción (como mucho de 30 segundos a 1 minuto).
La eliminación de los segundos mensajeros tiene lugar por vías diferentes según sea el segundo mensajero:
-cAMP y cGMP por fosfodiesterasas específicas.
-IP3 y DAG completan el ciclo de los fosfatidilinositoles.
Esto hace que termine la respuesta celular. La modulación cruzada en las vías de eliminación de los segundos mensajeros marca la prevalencia de las distintas vías de señalización celular en distintas respuestas celulares.
El retorno de la concentración de Ca2+ a niveles pre-enzimáticos sólo implica transporte. En todas las células de mamíferos, los sistemas más importantes para resetear los niveles de Ca2+ son las bombas de Ca2+ (Ca-ATPasa) del retículo sarcoendoplasmático y de la membrana plasmática. También hay un intercambiador de Na+-Ca2+ en la membrana plasmática, que colabora con los otros dos. Este intercambiador es importante en el corazón y en neuronas es secundario (pues aquí interviene en el control de la sobreestimulación).
Las proteínas fosfatasas eliminan las huellas de las fosforilaciones de las proteínas quinasas. Las 3 familias más importantes son:
-PrP-1: modulada por cAMP.
-PrP-2ª: modulada por cGMP.
-PrP-2B (calcineurina): modulada por calmodulina (CaM) y Ca2+. Es muy abundante en el tejido nervioso, pues la concentración de Ca2+ es crítica en este tejido.
La hiperestimulación celular sostenida puede producir muerte celular o cáncer
El caso más claro es la excitotoxicidad por glutamato (está relacionada a isquemias y reperfusión). En este caso, el mecanismo es una gran subida de calcio y ROS, que produce una necrosis oxidativa muy rápida. Este problema se combate con antagonistas de glutamato.
Otro neurotransmisor (en el sistema nervioso límbico) es la dopamina. La excitotoxicidad por dopamina está muy relacionada en el Parkinson.
Muchos tipos de cáncer y otras patologías están asociadas a disfunciones en las vías de transducción de señales extracelulares.
Una sobreestimulación en las proteínas G monoméricas produce cáncer, cólera e hipertensión; una hipoestimulación produce, por ejemplo, ceguera nocturna.


jueves, 20 de febrero de 2020

TEMA 23: VÍAS DE TRANSDUCCIÓN DE SEÑALES DE COMUNICACIÓN INTERCELULAR


-Receptores ionotrópicos:
Los prototipos de esta categoría son los receptores nicotínicos de acetilcolina y los receptores NMDA (canal de Ca 2+) y AMPA (canal iónico con baja selectividad para Ca2+ y Mg2+) de glutamato. Estos receptores están en las membranas postsinápticas.
Son receptores ionotrópicos activados por ligandos. El receptor nicotínicos actúa como un gatillo para disparar el potencial de acción.
Transducción y primera amplificación intracelular de la señal. Proteínas G
Las proteínas G se activan tras la activación del receptor. Las proteínas G son proteínas que unen GDP/GTP, tienen actividad GTPasa y requieren una proteína reguladora para intercambiar GDP por GTP. Son de dos tipos: proteínas G triméricas acopladas a receptores / TM y proteínas G monoméricas acopladas a receptores tirosina-quinasa.
-Proteínas G triméricas: llega el estímulo (ej: olor), activa al receptor, que hace que se pueda intercambiar GDP por GTP. La proteína G se carga con GTP. La subunidad alfa de la proteína G se separa de la beta y la gamma y se desplaza hasta su diana (en este caso, la adenilato ciclasa, que se activa y genera cAMP; ahora se abren unos canales de calcio y se inicia la respuesta al olor).
La estructura de las proteínas G triméricas se ha resuelto a nivel atómico. También se ha visto que las subunidades beta y ganma producen señalización.
Hay muchos tipos de proteínas G triméricas (isoformas, que se diferencian en dominios de interacción entre receptores). Algunos de ellos son:
-Gαs: es estimulada por los beta adrenérgicos, glucagón y hormona paratiroidea.
-Gαi: es inhibida por acetilcolina y alfa adrenérgicos.  
-Gαq: es activada por acetilcolina, alfa adrenérgicos y neurotransmisores, que producen un incremento de IP3 y calcio intracelular.
-Gαt: es propia de la retina (conos y bastones). Su diana es la fosfodiesterasa. Se activa por cGMP.
- Gα1,3: estimula el cambio de Na+ por H+. Se activa por trombina.
El agonista (señal) activa al receptor. En esta vía, la diana es la fosfolipasa C (PLC), que coge a fosfatidil inositol 4,5-Bisfosfato (PIP2) y lo escinde en diacilglicerol (DAG) e IP3, que difunde por la célula.
La PLC es una familia de proteínas. Aquí interviene la fosfolipasa Cβ, que posee varios dominos: dominio de interacción de proteínas G, dominio de unión de plectrina (de localización de citoesqueleto), dominio C2 (unión a las cabezas polares de los fosfolípidos) y dominio mano-EF (unión de Ca2+). Por tanto, esta enzima está en la membrana plasmática.
-Proteínas G monoméricas: los receptores acoplados a la actividad tirosina-quinasa actúan con una tirosina quinasa endógena o una tirosina-quinasa asociada, siempre unida al citoesqueleto. Intervienen unas proteínas G monoméricas. El elemento inicial básico que produce el crecimiento celular es Grb-2. Éste activa a la proteína monomérica G. Grb-2 tiene 2 dominios especiales, que permiten que se unan a Sos (primer producto de oncogén descrito) y Ras (proteína monomérica G). Ésta, por tanto, se activa. Por tanto, el intercambiador de GDP por GTP es la proteína Sos (su estructura se ha resuelto a nivel atómico).
Tipos de proteínas G monoméricas:
-Ras: regula el crecimiento celular. Su deficiencia produce cáncer.
-Rho: reorganiza el citoesqueleto.
-Arf: regula procesos que implican remodelación del citoesqueleto(endocitosis, exocitosis).
-Rab: endocitosis.
-Ran: transporte de RNA.
2ª amplificación y difusión intracelular de la señal: segundos mensajeros
La señal de Ca2+ difunde rápidamente desde el punto focalizado de inicio por todo el espacio celular. El calcio es el señalizador más importante. Se puede seguir muy bien por microscopía electrónica de fluorescencia. Los segundos mensajeros son moléculas que en general difunden con facilidad por la célula:
-cAMP: producido por la adenilato ciclasa.
-cGMP: producido por la guanilato ciclasa.
-Ca2+: entrada al citosol a través de canales y/o receptores ionotrópicos. Modula los niveles de cAMP y cGMP. Coordina la respuesta celular, pues tiene mucha capacidad de difusión. En general, la subida de calcio está asociada al IP3 y DAG.
-IP3: liberación de Ca2+ desde los orgánulos subcelulares (principalmente en el RE y las mitocondrias). Los receptores de IP3 se denominan canales de calcio sensibles a IP3.
-DAG: activa a la proteína quinasa C.
-Óxido nítrico (NO): es el activador de la guanilato ciclasa; por tanto, eleva los niveles de cGMP.
En definitiva, los niveles de cGMP están coordinados por Ca2+ (es el principal) y NO.
El segundo mensajero más importante es Ca2+. IP3 lo hace salir de los orgánulos subcelulares. En general, todas las células de mamíferos tienen unos niveles de calcio muy bajos (50-200 nM). El receptor activado por el agonista activa a PLC y ésta al IP3, que es el que libera el calcio.

TEMA 23: VÍAS DE TRANSDUCCIÓN DE SEÑALES DE COMUNICACIÓN INTERCELULAR


Receptores de las señales de comunicación intercelular
Las señales de comunicación intercelular se dividen en:
-Hormonas y factores de crecimiento:
            -Polipeptídicas: insulina, glucagón, ACTH, hormona del crecimiento, factores de crecimiento epidérmico (EGF), de plaquetas (PDGF) y de neuronas (NGF),...
            -Otras hormonas no permeables a través de la membrana plasmática: adrenalina y nor-adrenalina.
            -Liposolubles: tiroxina, hormonas esteroides y prostaglandinas...
-Neurotransmisores: acetilcolina, L-glutamato, GABA, serotonina, dopamina, adrenalina, histamina, adenosina,...
-Factores humorales locales: ácido araquidónico, leucotrienos, tromboxanos, histamina,...
-Citoquinas: factor de necrosis tumoral, Fas (apoptosis),...
Estas señales no tienen una única vía de señalización.
Los receptores de las señales de comunicación intercelular tienen distinta localización:
-Las hormonas y factores tumorales liposolubles se encuentran en el citosol y en el núcleo.
-Todos los demás se localizan en la membrana plasmática.
Tipos de receptores de la membrana plasmática:
-Receptores metabotrópicos: son receptores de 7 α-hélices transmembranas (7 TM); su respuestas es desde segundos a minutos.
-Receptores de hormonas y factores de crecimiento: acoplados a la actividad tirosina-quinasa; su respuesta es lenta: de minutos a horas.
-Receptores de muerte celular: acoplados a la activación de caspasas; su respuesta celular es lenta: desde minutos a horas.
-Receptores ionotrópicos: contienen un canal iónico en su estructura; la respuesta celular es muy rápida: en menos de un segundo (propios de células excitables, músculo y neuronas).
-Receptores metabotrópicos (7 TM):
Las señales extracelulares que captan son adrenalina y nor-adrenalina, glucagón, ACTH, dopamina, L-glutamato, acetilcolina, histamina, adenosina.
Están implicados en olores (ej: en el celo), fotones, sabor, visión, embriogénesis, desarrollo, carcinogénesis,...
La adrenalina fue un hito histórico en el estudio de la señalización.
Los receptores se denominan 7 TM porque tienen 7 α-hélices que atraviesan la membrana. El mayor número caracterizado corresponde a los receptores para olores. Se han clonado más de 1000 receptores 7 TM para los olores. En humanos hay 500 receptores distintos.


-Receptores acoplados a la actividad tirosina-quinasa:
Se denominan receptores activados por fosforilación cruzada. Los receptores de insulina, EGF y PDGF tienen el dominio catalítico tirosina-quinasa en su estructura, por lo que se denominan receptores RTK’s. El receptor de la hormona de crecimiento no tiene actividad tirosina-quinasa endógena (necesita acoplarse a otra tirosina-quinasa).
El factor de crecimiento provoca la dimerización del receptor y la fosforilación cruzada en tirosinas específicas.
En esta vía de transducción de señales son muy importantes los dominios proteicos SH2 (Src Homology 2), dominios de unos 100 aa que se unen fuertemente a péptidos que contienen fosfotirosina.

lunes, 10 de febrero de 2020

TEMA 22: METABOLISMO DE NUCLEÓTIDOS DE PIRIMIDINA Y PURINA


Esta estructura presenta un estado T (tenso) y un estado R (relajado). La unión de un producto final (CTP) con las subunidades reguladoras, hace que se estabilice el estado T.
La biosíntesis de novo de las purinas depende PRPP. AMP, GMP e IMP son inhibidores de PRPP.
Por tanto, el regulador de pirimidinas y purinas son las purinas. Los nucleótidos de purina bloquean la producción de PRPP cuando están en exceso, bloqueando también la síntesis de pirimidinas. Además, se bloquea también la biosíntesis de histidina (irrelevante para mamíferos, pues es un aa esencial).
El 2º punto de bloqueo está en la fosforribosilamina:
PRPP + glutamina à 5-fosforribosil-1amina + PPi
Además, la síntesis de novo de AMP requiere GTP, y la de GMP requiere ATP. Esta dependencia cruzada sirve para mantener balanceada la producción de ambos nucleótidos.
La reducción de ribonucleótidos a desoxirribonucleótidos está bajo control alostérico. El primer modulador es dATP. Niveles altos de dATP provocan la inhibición de la desorribonucleótido reductasa. La unión de ATP revierte esta inhibición. Por tanto, dATP es la señal primaria más relevante de abundancia de desoxirribonucleótidos.
dATP y ATP, en exceso, estimulan la reducción de los nucleótidos de pirimidina UDP y CDP.
El modulador pirimidínico de este sistema es dATP. Éste estimula la reducción de GDP e inhibe la reducción de los nucleótidos de pirimidina. El incremento en los niveles de dGTP estimula la reducción de ATP a dATP. Por tanto, existe una regulación cruzada de todos los nucleótidos.
-Reciclaje
No todos los nucleótidos son sintetizados de novo. Las células suelen reciclarlos. Estas vías son de reciclaje (salvage way).
-Adenina P-ribosil transferasa: Adenina + PRPP à AMP
-Hipoxantina-guanina P-ribosil transferasa: Guanina + PRPP à GMP + PPi
                                                                   Hipoxantina + PRPP à IMP + PPi
-Pirimidina P-ribosil transferasa: Uracilo + PRPP à UMP + PPi
Una vez producidos los nucleótidos:
-Nucleósido monofosfato quinasas (varias isoformas, ej: UMP quinasa):
            UMP + ATP ßà UDP + ADP
-Nucleósido difosfato quinasa (muy poco específica):
            XDP + YTP ßà XTP  + YDP
ATP como precursor metabólico
ATP es el precursor metabólico de NAD y NADP. Nosotros no producimos NAD desde 0. Dependemos de la vitamina niacina (nicotinato) para empezar a construir. Niacina se incorpora a PRPP y se forma un ribonucleótido nicotinato. A éste se le incorpora ATP y posteriormente glutamina aporta el grupo amino. Se obtiene el NAD+. NAD+ por una quinasa da NADP+.
ATP también produce FMN (a partir de riboflavina). Ahora FMN con ATP da FAD.
Patologías asociadas a desórdenes en el metabolismo de nucleótidos
-Gota: es producida por el exceso de ácido úrico (urato). El ácido úrico deriva de la oxidación de IMP, que libera hipoxantina. Ésta por la xantina oxidasa (utiliza O2 y produce H2O2) da xantina. Ésta por la misma enzima reciba otro grupo ceto (al igual que antes) y forma el ácido úrico, que en el organismo está en forma disociada (urato). El urato en exceso forma cristales, que son los responsables de los síntomas de la gota.
La guanina también entre en esta vía a partir de la xantina oxidasa. Un exceso de purinas produce gota.
En los seres humanos, los niveles de urato están casi al límite de solubilidad.
Prosimios à Seres humanos: aumento de urato (10 veces), que un antioxidante (ventaja evolutiva).
-Síndrome de Lesch-Nyhan: deficiencia en la hipoxantina fosforribosil transferasa (interviene en la vía de reciclaje de las purinas). Esto provoca un comportamiento autodestructivo compulsivo (automutilación y agresividad extrema: los individuos se muerden y arrancan los labios y los dedos), retraso mental y espasmos.
Consecuencias bioquímicas  metabólicas:
-Elevada concentración de PRPP.
-Notable aumento de la biosíntesis de novo de purinas.
-Superproducción de urato (con el paso de los años desarrollan síntomas de la gota).




viernes, 31 de enero de 2020

TEMA 22: METABOLISMO DE NUCLEÓTIDOS DE PIRIMIDINA Y PURINA


IDP e ITP no son muy abundantes, pues no se generan a partir de nucleósidos monofosfato (como ocurre en pirimidinas).
IMP genera AMP y GMP. Para producir AMP hace falta un cofactor (además del aspartato): el GTP. Para producir GMP hace falta ATP. Esto se debe a que las células necesitan un nivel balanceado de ATP y GTP.
El grupo carbonilo del IMP se activa por GTP (proteína G), se forma adenil-succinato y se libera fumarato, formando adenilato AMP.
Para dar GMP, el IMP se oxida a xantinamonofosfato, que es el precursor de guanina (por una reacción muy parecida a la carbamil-P sintetasa y CTP sintetasa: es la GMP sintetasa).
Ahora AMP y GMP pasan a ADP y GDP y éstos a ATP y GTP.
Biosíntesis de los desoxirribonucleótidos
Se producen a partir de los ribonucleótidos. Intervien la ribonucleótido reductasa. Ésta presenta diferentes cofactores y subunidades según el organismo.
En E.coli hay dos subunidades: R1 (catalítica: 1 Glu y 3 Cys) y R2 (reguladora: agrupación de His y Glu con dos átomos de Fe cerca de una Tyr). En otros organismo no está R2, sino cianocobalamina.
El mecanismo catalítico es radicálico. Se le quita un electrón y un protón a la cys del centro catalítico, formando un radical que es el que ataca al ribonucleótido.
La tyr de la subunidad R2 es la que quita el electrón a la cys, formando un radical de tyr. El radical que queda en la cys (S-) ataca a la ribosa,quitándole un electrón. Se forma un radical ribosilo.
Esto se equilibra perdiendo agua y ya ha aparecido la desoxirribosa. El radical migra a la posición anterior y resetea.
Se libera la desorribosa, pues se ha perdido un anclaje con la enzima. En la última etapa se recupera el electrón a la cys. La enzima se queda casi igual que al principio. Hay una diferencia: los dos tioles forman un puente disulfuro. Esto hace que la enzima no pueda empezar otro ciclo. El puente disulfuro debe reducirse a dos tioles separados. Esto lo hace la tiorredoxina-tiorredoxina reductasa. Este sistema gasta NADPH.
Por esto, la biosíntesis de desoxirribonucleótidos requiere NADPH.
En algunos organismos la fuente de radicales es la adenosilcobalamina, no una tirosina.
Dado que las enzimas primordiales se inactivaban por el oxígeno, la existencia de una arquitectura proteica común para las ribonucleótidos reductasas sugiere que las proteínas se incorporan al mundo de RNA antes de que el DNA hubiese evolucionado como forma estable de almacenamiento de la información genética.
Biosíntesis del timidilato (dTMP)
Se produce a partir de dUMP. La diferencia de T con respecto a U es la presencia de un metilo en posición 5’ (el donador del metilo es el metilentetrahidrofolato). Se genera el timidilato (dTMP).
El tetrahidrofolato está actuando transfiriendo electrones. Se genera dihidrofolato, que pasa a tetrahidrofolato (depende de NADPH) y éste se carga a metilentetrahidrofolato (el donador es serina).
Este ciclo es específico para construir el DNA. Los inhibidores de estas enzimas se utilizan en la quimioterapia. Hay dos puntos de ataque: timidilato sintasa (se utiliza fluorouracilo) y dihidrofolato reductasa (aminopteria y metrotexato: Ki = 1nM, por lo que es muy selectivo). El bloqueo de la timidilato sintasa por fluorodesoxiuridilato es un ejempli de inhibición suicida (modificación covalente o estable del centro catalítico).
Regulación de la biosíntesis de novo de los nucleótidos y su reciclaje
La biosíntesis de novo de las pirimidinas tiene un control alostérico por inhibición. La ATC depende de la concentración de aspartato. Las subunidades reguladoras son dímero y las catalíticas son trímeros.

lunes, 20 de enero de 2020

TEMA 22: METABOLISMO DE NUCLEÓTIDOS DE PIRIMIDINA Y PURINA


Biosíntesis de novo de los nucleótidos de pirimidina
La procedencia de los átomos del nucleótido de pirimidina es en parte del aspartato. Los otros dos átomos del anillo de 6 miembros provienen del carbamil-P.
Una vez sintetizado el anillo de pirimidina, se empieza a sintetizar el nucleótido. Es decir, el anillo se une a una fosforribosa activada (mediante la formación del pirofosfato de ribosa).
Primero se genera UTP, que es la precursora metobólica de CTP y de dTMP. CTP es el precursor de dCTP.
La carbamil-P sintetasa realiza la activación de un grupo carbonilo por fosforilación para formar carboxi-P. Éste sufre un ataque nucleófilo, formando ácido carbámico. Éste por fosforilación de carbamil-P.
La carbamil-P sintetasa está muy estudiada. Tiene tres dominios diferenciados (la isoforma citosólica): El dominio de unión del donador de nitrógeno (glutamina), el dominio de fosforilación del bicarbonato y el dominio de fosforilación del ácido carbámico.
El amonio liberado difunde hasta el dominio de fosforilación del bicarbonato; el ácido carbámico migra al dominio de fosforilación del ácido carbámico, para dar carbamil-P. Éste a pH 7 es muy inestable y se descompone, por lo que debe estar protegido del medio externo.
La siguiente etapa es muy importante en la regulación. Está catalizada por la aspartato transcarbamilasa (ATC). Ésta tiene 6 subunidades catalíticas y 6 subunidades reguladoras.
El carbamil-P se condensa con aspartato, formando carbamil-aspartato, quien se cicla formando un enlace amida y da lugar al dehidrooro, que se oxida y forma oorotato (está catalizado por la dihidroorotato deshidrogenasa).
Cuando el oorotato se condensa con PRPP se forma orotidilato, que mediante una descarboxilación se transforma en UMP (primer nucleótido sintetizado). Está catalizada por la orodilato descarboxilasa. UMP se transforma en UTP, mediante una acción secuencial de nucleósidos-monofosfato quinasas y nucleósidos-difosfato quinasas (UMPàUDPàUTP).
UTP es el precursor de CTP (mediante una sustitución de un grupo ceto por un grupo amino) por la CTP sintetasa, que es muy parecida a la carbamil-P sintetasa. Es una reacción muy idéntica a la de la formación del carbamil-P.
Biosíntesis de novo de los nucleótidos de purina
La estructura del anillo de purina proviene de la acción combinada de varios compuestos. Aspartato es el donador de un nitrógeno. CO2 dona un carbono. Glutamina dona dos N y el tetrahidrofolato dona 2 C y glicina dona el último C.
Los nucleótidos de purina se construyen sobre ribosa-P directamente (se sintetiza directamente el nucleótido, no el anillo como ocurre en pirimidinas). El primer nucleótido generado es IMP. Es el precursor de ATP y GTP en el RNA y de dATP y dGTP en el DNA.
Tipos de reacciones repetitivas:
-Activación por fosforilación de un grupo carbonilo.
-Sustitución del grupo fosfato por amoniaco o por un grupo que actúa como nucleófilo.
A la ribosa 1-PPi se le incorpora un amino y luego una glicina, formando glicinamida ribonucleótido. Éste coge THF y da formilglicinamida ribonucleótido y éste coge glutamina y da formilglicinamidina ribonucleótido. Éste da 5-aminoimidazol ribonucleótido (ciclación por activación con ATP). Éste se activa y se realiza una migración tautomérica. Ahora hay otra activación y otro ataque nucleofílico, formando el succinil-derivado del nucleótido (es la misma reacción repetida “n” veces).
A partir de este derivado succinil, para llegar a IMP, hay varias etapas. Aspartato dona un nitrógeno y se libera fumarato. Ahora se incorpora otro THF. Hay una deshidratación y se produce inosinato (IMP). La base púrica contenida en el IMP es la hipoxantina.

viernes, 10 de enero de 2020

TEMA 21: BIOSÍNTESIS DE LOS AMINOÁCIDOS


La inhibición es de tipo alostérico. La 3-P-glicerato deshidrogenasa es un tetrámero: posee dos centros de unión para serina y dos para NADPH. La inhibición más potente es la de serina.
Las células necesitan coordinar los niveles de unos aa con otros. Para ello utilizan retroinhibición por retroactivación. Ej: ruta de biosíntesis de aa con cadenas laterales alifáticas. Se intenta mantener unos niveles balanceados de leu, val e ile. Todas provienen de hidroxietilo-TPP. Las dos rutas divergen a partir del hidroxietilo-TPP. Una vía coge α-cetoglutarato (que es la que se modula). Se utiliza ile para inhibir su producción (cuando está muy alta). Val atenúa la inhibición por ile. Por tanto, el flujo metabólico se regula de una forma balanceada cruzada.
Lys, met y thr proceden de aspartato. Comienza con la formación de aspartil-P (mediante aspartato quinasa). Esta enzima es el punto de control. Se sintetizan isoenzimas de la aspartato quinasa. Hay 3 isoformas: una que no se regula por aa. finales, otra que es sensible a thr y otra sensible a lys.
La regulación más importante está a nivel de la glutamina sintetasa. Es un sistema alostérico muy importante. Es un control alostérico por modificación covalente post-traduccional y retroinhibición acumulativa (2 mecanismos).
Es una enzima con dos anillos con 6 miembros cada uno. La modificación postraduccional es una adenilación: la enzima se modifica por la incorporación de AMP. El donador de AMP es ATP y se libera PPi (reacción irreversible hacia la derecha). El sistema que la activa es la adenilil-transferasa, que requiere un cofactor proteico: PA (proteína adenilante). También hay una proteína desadenilante (PD). Son la misma proteína con dos actividades diferentes.
La adenilación tiene lugar en un residuo de tyr de esta enzima. La adenilación disminuye la actividad de la glutamina sintetasa. Pero todavía queda actividad. Los niveles de productos del metabolismo del N de la célula terminan de cerrar la actividad de la glutamina sintetasa.
Por tanto, hay retroinhibición acumulativa. Los compuestos que informan de la cantidad de N son trp e his, pero también carbamil-P, glucosamina-6-P y CTP y AMP.
La proteína reguladora P es un trímero (trisquelión) que puede actuar en un hexámero. Se encuentra en dos estados: PA y PD (dos estados conformacionales diferentes de la misma proteína). El cambio conformacional lo produce una uridilación. La transformación de PA en PD requiere UTP, que se esciende pirofosfatolíticamente. B estimula la desadenilación de la glutamina sintetasa.
(Por tanto, la proteína P es un integrador del flujo metabólico hacia las bases púricas y pirimidínicas).
Glutamina inhibe la transformación de PA en PD y activa la transformación de PD en PA. Por tanto la glutamina inactiva a la glutamina sintetasa.
α-cetoglutarato y ATP activan la transformación de PA en PD e inhiben la transformación de PD en PA. Por tanto, ATP y α-cetoglutarato activan la glutamina sintetasa.
Los aa son los precursores de muchas biomoléculas. Biosíntesis de porfirinas y porfirias
Glicina y serina son los precursores de los derivados de los aa.
La selenocisteína es el aa nº 21. Es un aa que está presente en muchos seres vivos (pero no en todos). Se encarga de resetear peróxidos. Se condensa con glutatión y forma selenolato, que reduce peróxidos.
Las porfirinas se sintetizan en animales y bacterias a partir de glicina y succinil-CoA. En plantas es a partir de glutamato.
Durante esta ruta se produce la cobalamina (deriva de una porfirina 1ª).
La protoporfirina IX genera el grupo hemo en eucariotas y procariotas y las ficobilinas de algas.
Si a la protoporfirina IX se le une Mg, se forma la clorofila a, que forma las otras clorofilas.
La biosíntesis del grupo hemo en animales y bacterial comienza con succinil-CoA, que se condensa con glicina y forma el δ-amino-levulinato. Se utiliza la δamino-levulinato sintasa, que es una enzima mitocondrial que contiene PLP.
Dos δ-amino-levulinatos se condensan y se produce porfopirinógeno. Un tetrapirrol necesita, para formarse, 8 δ-amino-levulinato.
Se genera el 1-porfirinógeno 3 por la enzima cosintasa, que en última instancia es el precursor de protoporfirina IX. Los déficits de cosintasa producen personas pálidas.
Las personas con uroporfirinógeno I poseen dientes rojos, que en la oscuridad se ven fluorescentes, la orina es roja, la piel es sensible a la luz y tienen disfunciones neurológicas severas (son “vampiros”).
Las personas con porfirias padecen locura transitoria.
-La degradación del grupo hemo produce biliverdina y bilirrubina (ictericia natal, si hay mucha acumulación). La degradación de los tetrapirroles requiere oxígenos (intervienen oxigenasas).